Vzhledem ke svému účelu a povinnostem spadá kolektivní systém pod kontrolu místních úřadů, které posuzují řádné provádění směrnice o OEEZ. Akreditace, plnění obchodního plánu a provoz EKOLAMPu tak spadá do kontrolní pravomoci Ministerstva životního prostředí ČR.
EKOLAMP zavedl celou řadu kontrolních mechanismů k dosažení efektivní činnosti, spolehlivosti účetního výkaznictví i dodržování pravidel a předpisů. Tato činnost je vykonávána dozorčí radou, vedením a samozřejmě všemi pracovníky. Vedle toho je EKOLAMP objektem interního auditu prováděného na roční bázi nezávislou třetí stranou. Tento audit prověřuje různé oblasti včetně financí, logistiky a recyklace, uzavírání smluv atd.
